医院在治疗口臭时会针对病因，主要是选择一般性治疗，药物性治疗或者手术治疗。需要结合口臭的实际原因生理性因素，可以注重于对应的改善病理性因素，就需要治疗疾病。
一、 生理性因素
生理性因素造成的口臭，一般不需要选择特殊的处理，比如抽烟、遗传性因素、吃了一些刺激性的食物，都可能会引起口臭，在此时可以用淡盐水来漱口。另外还需要戒烟，保持清淡的饮食，选择正确的刷牙，通过这些方面可以有效避免口臭的形成。
二、 口腔炎症的处理
口臭可能和口腔疾病有关，比如牙结石，口腔溃疡，龋齿，牙龈炎，以及牙周炎里面含有的细菌比较多，就会形成口臭。临床上可以在医生的指导下选择具有抗生素效果的药物，比如四环素或者是甲硝唑，轻松可以缓解口臭。龋齿所导致的口臭，可能是牙齿完整性受损，一般可以选择根管治疗，如果比较严重还可以拔除龋齿，能有效去除口臭。
三、口腔之外的疾病
呼吸系统疾病，胃肠疾病同样会导致口臭，比如慢性扁桃体炎会滋生大量的细菌形成口臭。可以在医生的指导下选择青霉素类药物治疗，或者是选择含漱液漱口，都有一定效果。胃肠系统疾病会导致胃酸反流，刺激到胃部黏膜，然后就有发炎的症状，在此时就会导致口臭，可以在医生的指导下选择一些具有中和胃酸以及保护胃黏膜的药物。比如可以选择兰索拉唑或者是硫糖铝，可以有效改变多方面的不是问题。伴随着原发性疾病，逐渐被控制口臭的症状就可以慢慢的缓解，具有多方面的优势，还可以有效改善呼出的异常气体，拥有较好的效果。
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