1、科属区别
金枪鱼是海鱼，为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、硬骨鱼纲、鲈形目、金枪鱼亚目、金枪鱼科、金枪鱼。
三文鱼是淡水鱼，为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、辐鳍鱼纲、新鳍亚纲、鲑形目、鲑科、鲑属与鳟属。
2、形态区别
金枪鱼的体形较长，粗壮而圆，呈流线形，向后渐细尖而尾基细长，尾鳍为叉状或新月形，尾柄两侧有明显的稜脊，背、臀鳍后方各有一行小鳍，具有鱼雷体形，其横断面略呈圆形。
三文鱼的体形侧扁，背部隆起，齿尖锐，鳞片细小，银灰色，产卵期有橙色条纹，肉质紧密鲜美，肉色为粉红色并具有弹性，鳞小刺少。
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