1、 茎的结构不同，木本植物的茎部含有大量的木质，比较坚硬。草本植物的茎部比较柔软，茎多汁。
2、生长周期不同，木本植物为多年生植物。草本植物则分为一年生、二年生和多年生。
3、形态不同，木本植物比草本植物高大直立，其中乔木主干明显，分枝部位比较高。
4、 生长习性不同，草本植物中一年生、二年生和多年生的习性会发生变化。如小麦和大麦在秋播时为二年生草本，在春播时则成为一年生草本。
多年生草本植物，植物的地下部分能生活多年，每年都发芽生长。 如：大理菊、马铃薯、甘薯等。木本植物中的半灌木，植物多年生，但仅茎的基部木质化，而上部为草质，冬季枯萎，如牡丹。
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